农业三产融合发展面临的主要问题是多方面的，第一，长期以来沿袭传统的农业发展方式和种植业结构，三产融合发展的理念滞后；第二，三产融合发展的经营载体缺乏，融合主体引领作用不强，阻碍了农业产业化的实现；第三，三产融合发展的工业化水平低，产业链延伸和集群发展不够；第四，三产融合中的现代农业服务业功能弱化，发展滞后；
成都红星城乡规划设计研究院认为三产融合的发展应从观念上突破传统农业的束缚，用现代工业理念做大农业，用现代流通理念做活农业，用现代金融理念做强农业，用现代生态理念做好农业，用规模化、产业化理念发展农业；树立大农业观，拓宽农业发展的内涵和外延，充分利用农村和城市市场、国内和国际市场，使工农、城乡关系良性互动，一二三产业融合发展，采取以龙头企业+合作社+基地+种植农户，产供销一条龙的运作模式，打造从田园到餐桌的经营理念，以蔬菜生产为基础，增加观赏、垂钓等休闲农业功能。
农村一二三产业融合包含多种形态，而且按照不同的标准可分成不同的类型。从所涉及产业的关系来看，可分为横向产业融合和纵向产业融合，前者主要是指产业链的拓宽，即农业具有了其他产业的功能，后者主要是指产业链的延伸，即农业与其他产业联系在一起。从融合主体的性质来看，可分为内源性融合和外源性融合，前者是指以农户、专业大户、家庭农场或农民合作社等农业生产主体为基础的融合发展，后者是指以农产品加工或流通企业等非农业生产主体为基础的融合发展；从融合发展的路径来看，可分为组织内融合和组织间融合，前者是指家庭农场、农民合作社等办加工和销售，或农业企业自建基地一体化经营，在产业组织内部实现融合，后者是指龙头企业与农户、家庭农场、合作社等合作，在产业组织间实现融合。
成都红星城乡规划设计研究院认为，第一，强化政府部门的联动效应。产加销、贸工农相互脱节现象一直是制约农业产业化的重要因素。第二，加强基础设施的建设，如道路、通讯、电力、供气、供水、排水等，要实现较好的一二三产业融合发展效果，为社会投资主体参与现代产业融合提供良好条件。第三，引导现代要素向农村流动，要素聚集是一二三产业发展壮大的基础。第四，做好新型经营主体培育。农村一二三产业融合发展是一项系统性工程，涉及面广、复杂性强，新技术、新业态、新商业模式贯穿其中，对经营主体的要求相对较高。第五，促进农业适度规模化经营，要充分实现农村一二三产业融合发展，需要进行大规模基础设施、科技创新、品牌培育等方面的投入。
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